Истоки реки Анюй находятся в районе Тардоки-Яни – самой высокогорной части Сихоте-Алиньского хребта, а впадает река в устье Найхинской протоки. Длина Анюя - 393 км. Анюй является правым притоком Амура и имеет собственные притоки– реки Манома, Дымни, Поди, , Тормасу, Гобилли, Моади. В верхнем течении Анюй является типично горной рекой; в нижнем течении – носит равнинный характер, протекая по широкой долине с низкими болотистыми берегами; вблизи устья разбивается на рукава, протоки и старицы.
Русло Анюя изобилует мелями, косами, каменистыми порогами. Питается Анюй летне-осенними дождями, поэтому наивысший уровень воды наблюдается в июне - августе.
В ландшафте русла Анюя множество следов древнего оледенения: кар, небольших ледниковых озер, морен. Здесь хорошо выражена вертикальная поясность растительности: от смешанного леса близ русла реки до горной тундры.
Очень живописны участки врезанных меандр, скалы, пороги и береговые обрывы. Вызывают интерес утесы в месте впадения рек Тауса, Яко и Яко-Западная; скала Надге (ниже устья реки Гобилли); здесь же находится очень красивый ступенчатый береговой обрыв.
Бассейн Анюя мало заселен; на сегодняшний день здесь всего три населенных пункта - два на реке Маноме и один на Анюе.
Анюй является нерестилищем ценных лососевых пород рыб, здесь много памятников природы, таких как: скалы на участках меандр, скала Надге, береговые обрывы на реке Пихце, водопад Сагена близ урочища Саргино. Уникальными творениями природы являются скалы “Мэка”, останцы горы Тигровый Дом в бассейне реки Мухен. Здесь еще обитают тигры.
В бассейне Анюя издревле селились нанайцы и удэгейцы. В бассейне Анюя произрастает более 1000 видов растений.
Леса Анюя имеют большое природоохранное значение, так как включают в себя многие виды кормовых и редких растений.
В бассейне реки встречаются около 300 видов позвоночных животных, включая 7 видов земноводных, около 30 видов рыб, не менее 6 видов пресмыкающихся, около 50 млекопитающих (в том числе завезенных – американская норка и ондатра), около 200 видов птиц (включая зимующих и пролетных).
Из редких животных здесь обитают тигр, амурский лесной кот, гималайский медведь. Вблизи устья Анюя встречается дальневосточная черепаха.
Более 20 видов птиц, гнездящихся на Анюе, отнесены к редким и исчезающим:мширокорот, черный коршун, тетерев, орлан-белохвост, беркут, иглоногая сова, черный журавль и другие. Обычны здесь скопа, большой баклан, мандаринка.
Из промысловых рыб в Анюе водятся: таймень, кета, ленок, хариус, сом, амурский, язь амурский.
Анюй является наиболее важной лососевой рекой в бассейне Амура. Лосось обеспечивает прекрасную кормовую базу для водных беспозвоночных, всех видов рыб (ленок, хариус, таймень), птиц и некоторых млекопитающих (медведей, кабана, выдры, американской норки, енотовидной собаки и др.).
Весь бассейн Анюя является частью территории Анюйского национального парка–местом традиционного природопользования нанайцев и удэгейцев. Национальный парк Анюйский обладает богатыми возможностями для развития экологического (фото- и видеосъемка, наблюдение), рыболовного и охотничьего туризма. Большие перспективы развития имеет сплав по реке Анюй.